如果让你来设计一段已知dna序列的上下游引物,应该注意哪些方面
来源:学生作业帮 编辑:搜搜做题作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/04/28 05:33:59
如果让你来设计一段已知dna序列的上下游引物,应该注意哪些方面
引物设计原则:
1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性.
2、G十c含量:应在45%一55%之间,PCR扩增中的复性温度一般是较低Tm值引物的Tm值减去5—10度.引物长度小于20时,其Tm恒等于4×(G十C)十2×(A十T).
3、碱基分布的随机性:应避免连续出现4个以上的单一碱基.尤其是不应在其3’端出现超过3个的连续G或C,否则会使引物在G十C富集序列区错误引发.
4、引物自身:不能含有自身互补序列,否则会形成发夹样二级结构.
5、引物之间:两个引物之间不应有多于4个的互补或同源碱基,不然会形成引物二聚体,尤应避免3’端的互补重叠.
1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性.
2、G十c含量:应在45%一55%之间,PCR扩增中的复性温度一般是较低Tm值引物的Tm值减去5—10度.引物长度小于20时,其Tm恒等于4×(G十C)十2×(A十T).
3、碱基分布的随机性:应避免连续出现4个以上的单一碱基.尤其是不应在其3’端出现超过3个的连续G或C,否则会使引物在G十C富集序列区错误引发.
4、引物自身:不能含有自身互补序列,否则会形成发夹样二级结构.
5、引物之间:两个引物之间不应有多于4个的互补或同源碱基,不然会形成引物二聚体,尤应避免3’端的互补重叠.
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如果要使用PCR扩增一段已知的DNA序列,要如何设计引物
已知下游引物序列,怎么去基因DNA上找到这个序列?如给定3-GTGTATGTGGCAATGCGTTC
如何用 VECTOR NTI设计一段已知DNA序列的PCR引物
引物设计问题我是个菜鸟,想问一下,如果给你一段DNA序列,如ggattcgtagctagtatttgcaggtagctt
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PCR的意义是不是要先知道具体DNA序列后才能设计引物进行PCR?如果是,那么我得到的是一段已知的序列,好像也可以人工合
不知序列的DNA模板PCR引物的设计
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PCR引物设计应该注意的问题?
给出dna序列怎么设计引物
高分~~急求!如果要用PCR扩增下列序列,请写出上游引物和下游引物的序列