作业帮 > 综合 > 作业

RT-PCR怎么都没法克隆出目的片段

来源:学生作业帮 编辑:搜搜做题作业网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/06/16 22:03:27
RT-PCR怎么都没法克隆出目的片段
我用的上下游引物tm值相差较大,解决办法是先用低的退火温度跑5个循环,然后再用高退火温度的跑25个循环.试剂盒使用的是takara 一步法RT-PCR KIT请问各位针对这种情况有什么相应的解决办法?或者是经验?请与在下分享一下
RT-PCR怎么都没法克隆出目的片段
博凌科为-为你你这样解决不了问题.像你现在使用的 2 step PCR不是用来解决上下游引物退火温度不一致的,而是用来解决引物不完全配对的情况的,比如克隆基因使用的引物因为和存在游离的内切酶位点,所以不能完全和cDNA模板配对,才在反应的前5个循环使用较低的退火温度.待到和引物完全互补的模板增加到一定量量后使用高退火温度.所以你的方法根本就用错了.你这样的情况建议你试用梯度温度,从高退火温度降低到低退火温度慢慢找吧.理论上讲,两个引物的退火温度不一致,应该是使用低退火温度才对,虽然这样会降低引物的特异性.其实,最直接的解决办法,还是你直接设计新的引物把.设计个引物可能比你浪费掉的那些试剂要便宜.