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关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种

来源：学生作业帮 编辑：搜搜做题作业网作业帮 分类：综合作业 时间：2024/04/29 18:39:40
关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种
1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去双向测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?如何鉴定.两条链如下：
CAAGGGGGCATCCTATCTGCAGTCGAACGAAACTTCTTTATCACCGAGTGCTTGCACTCACCGATAAAGAGTTGAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGGCAACCTGCCCAAAAGAGGGGGATAACACTTGGAAACAGGTGCTAATACCGCATAACCATAGTTACCGCATGGTAACTATGTAAAAGGTGGCTATGCTACCGCTTTTGGATGGGCCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCTTACCAAGGCAATGATGCGTAGCCGAACTGAGAGGTTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGGCGAAAGCCTGATGGAGCAACGCCGCGTGGGTGAAGAAGGTCTTCGGATCGTAAAACCCTGTTGTTAGAGAAGAAAGTGCGTGAGAGTAACTGTTCACGTTTCGACGGTATCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGGGAACGCAGGCGGTCTTTTAAGTCTGATGTGAAAGCCTTCGGCTTAACCGGAGTAGTGCATTGGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGGCTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGTTCGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCTAAGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCTGCAGCTAACGCAATAAGCATTCCGCCTGGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGGAGCATGTGGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCTTTTGCCAATCCTAGAGATAGGACTTTCCCTTCGGGGACAAAATGACAAGTGGTGCATGGTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGAATGTTGGGTTAAGTCCGCAACGAGCGCATCCTTTACTCGACTAGTTGGCTAGCATTAAGCTGGGTCACTCTAGCTAGACTGGCTGTTGACAATCTGCAGGCAGGTGGGATGACGTCGAATCATCAATGCCCCATTTATGAACCTGGGGCTTAACACACACC
CTTTGATCCCATTAGACGGCTGGCTCCAAAAGGTTACCCCACCGGCTTTGGGTGTTACAAACTCTCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCGACTTCATGTAGGCGAGTTGCAGCCTACAATCCGAACTGAGAACGGCTTTAAGAGATTTGCTAAACCTCGCGGTCTTGCGACTCGTTGTACCGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTCACCGGCAGTCTTGCTAGAGTGCCCAACTTAATGCTGGCAACTAACAATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCATTTTGTCCCCGAAGGGAAAGTCCTATCTCTAGGATTGGCAAAAGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAATGCTTATTGCGTTAGCTGCAGCACTGAAGGGCGGAAACCCTCCAACACTTAGCATTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAACCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAGAGCCGCTTTCGCCACTGGTGTTCTTCCATATATCTACGCATTTCACCGCTACACATGGAGTTCCACTCTCCTCTTCTGCACTCAAGTCTCCCAGTTTCCAATGCACTACTCCGGTTAAGCCGAAGGCTTTCACATCAGACTTAAAAGACCGCCTGCGTTCCCTTTACGCCCAATAAATCCGGATAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGATACCGTCGAAACGTGAACAGTTACTCTCACGCACTTTCTTCTCTAACAACAAGGATTTTACGATCGAAGACGGTCTCACCCACGCGGCGATGCTCATCAGCTTTCGCCATTGTGTGATGCCTACTGCTGCCTCCCGTAAGAGTTGGGCGTGTTCTCAGGTCATGTGCCGAATCGAGCTTCTCAGTCCGCTACGCAATCAATTGGCCTTGGTTTAAGC
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关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种
用contig 1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行BLAST.BLAST结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌Max ident均为96%.
关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种 关于DNA序列在NCBI上比对的问题 动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似 怎样在NCBI上查找棉铃虫类胰蛋白酶的DNA序列 ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. 关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题 NCBI中双序列比对BLAST结果相关问题 我把在NCBI上比对结果为99%的序列,拿来和我的序列再用DNAMAN比对一下,发现相似度只有30%了,为什么呢? 怎么在NCBI上比对其他基因? NCBI上对序列的描述中olrim是什么意思? 如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对 关于一段NCBI上没有的基因序列