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文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?

来源:学生作业帮 编辑:搜搜做题作业网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/05/15 21:25:46
文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?
文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?
有基因序列号,你就可以直接上genebank下载其序列,下载到全序列,你需要扩增的CDS区,也就是编码区,可以全外显子扩增,这样简单一点,也可以做cDNA克隆,然后再做,前者的话就可以直接根据其基因序列NG号设计引物,如果是做CDNA的话就根据其mRNA的序列NM号设计引物.
再问: 我直接根据genebank上的cDNA设计了引物,因为没有找到同源性比较接近的。所以直接就是拿那个基因的序列设计的,引物长度是24bp。可是没P出来。请问我这种情况,还有别的方法可以设计引物吗?谢谢了。
再答: 你是根据其cDNA设计的引物,你需要下提取mRNA,然后反转录成cDNA,才能够扩增出来。如果是根据其基因序列设计的,你需要先将你的目的序列定位到GENE上,然后设计引物