搜搜做题作业网NCBI保守结构域预测结果中的specific hit是什么意思?
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/06/23 05:16:26
同一家族的基因序列做对位排列看低变区即可.
就是同一条miRNA在不同物种之间序列是相同的
灰色系统预测数量,线性回归预测结构
结果!一声,其他都是二声调.
对序列匹配程度进行评分后得出的分值
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/
好像用proteinworshop可以看
预测出的二级结构上标注了自由能自由能越高越不稳定容易发生转变
我预测蛋白质结构域都是在smart上预测的,是个在线的网站,基本还是蛮准的,另外还有许多网站提供在线预测,不过我只用过smart
结构预测是有意义的,因为通过实验来确定结构仍然要比通过实验确定序列慢得多.结构预测帮助我们理解蛋白质的功能和作用机制,对合理的药物设计也是很有意义的.（理论基础） 蛋白质结构在进化中要比蛋白质序列保
我可以告诉你,那是不可以能的.一个物种所包含的蛋白质有多少种?NCBI中储存的数据是按照单个蛋白质序列贮存的,而且都只是序列,NCBI不是二级结构数据库,要找二级结构去PDB找,在说了,就算你找到了所
原理很简单后者是前者的子集.chromosome只包含所有已经测序的基因组数据.估计你的序列可能只是在高等生物中保守,所以才会出现选择chromosome数据库时相似数量下降非常多.在做BLAST的时
NCBI对Blast的原理和结果有专业的说明http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
这可是个生物信息学大难题,搜搜“同源模建”,一大堆参考资料可以找到.不列举了
一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了.需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有
你登记账户后,这个栏目下可以保存你的检索记录,包括文献,序列等等.
shenye.judy(站内联系TA)其实有很多,找本生物信息学书上就有方法!fengyalan2(站内联系TA)预测功能域的我不知道,但是我知道swissProt上可以预测三维结构,你也可以在ncb
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多
真有叫ABC的结构域呀...在structure里输入("ABC"[PDBDescription])AND"homosapiens"[Organism]试试看是不是你要的.关键词比较多,最好用Adva