上游引物和下游引物怎么设计
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/06/16 02:45:20
合成的单链在实验时又一个和模板结合的退火过程,在这个过程中会自动形成茎环结构,如果你的茎环结构设计合理的话.我也在类似文献上看到过上游引物含有额外的碱基,上面有说明的,是为了调整Tm值.上游引物不能全
用PP5.0或oligo软件.网上有很多说明书的,操作十分简单再问:等于白说
这是基础知识问题,请抬头,看本页面的导航栏,找到专题,点击进去有个引物设计专题,把上面的资料都研究透彻了,如果还不会再问.同时你也可以去生物秀论坛pcr实验版块看看,相关文章很多.………………
使用引物设计软件,如果可以最好找公司设计合成,这样有保证.再问:老师要我们自己设计啦···杯具··再答:挺有难度,到网站上找一些设计原则看看。再问:谢谢啦,已经搞定啦··
FPrimer:5'-TTGTAAAAAAATTAAATTAA-3'RPrimer:5'-CATATTTTAATTAATATTTC-3'你这个序列AT含量太高,尤其是5'端A有7个连续重复,引物本身很
上游:5ggaattcatgtttagtttgaaaaaaac3下游:5gggttcgaattagacattgccaacatatt3你要的并不是鉴定引物,而是扩增引物根本不用软件
这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
用primerpremie
Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC.看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所
是从NCBI里面的序列库中搜索的,自动搜索符合筛选条件的序列,从而给出引物序列blast是要求NCBI里面有的序列才能验证.你研究的物种基因组测序结果发布了吗?如果发布了的话就不用担心序列不全了
个人推荐使用PrimerPremier5
上游引物:GAATTCacgcgcaagattagg(后面可以继续加几个碱基,用PRIMER5.0看一下,引物设计多少个碱基合适,每个基因序列不同.我用TOYOBO的KODPLUS的话,就一般引物设计
5':CGGAATTCACGCGCAAGATTAGGTGGGG3':CGGGATCCCCTTGGGAAGAAAAAGCAAG引物组成为:保护碱基+酶切位点+目的基因末端序列.由于你要扩增全部这段序列,
一般使用primer5就挺好,不知道你是扩基因还是启动子,基因是否是已知.PCR引物设计原理:PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关
普通PCR规则:1、18-25bp;2、Tm值在45-60;3、2个引物之间没有超过5bp的互补序列;4、CG%在40-60%;5、避免连续出现3个以上的CCC或GGG;6、不要迷信百度.
不,需要两条,因为随着你PCR的进行,另一条互补链会被引物扩增出来,因此你需要两条引物都加进去.再问:那么我引物设计的时候,是不是以mRNA为模版与以CDNA为模版设计的引物都可以?再答:都可以,别忘
NCBI上面得到的是mRNA序列可以用oligodt反转录,也可以用与mRNA互补的特异引物来反转录再问:恩,特异性引物有一对,上游和下游,老师问我用上游还是下游,望回答具体点再答:反转录当然是下游了
一般认为Tm-5度.但是要看你的Tm计算方法,不同公司合成的引物得出的Tm都不一样,你可以做个梯度PCR看看最适退火温度,以后就有经验了.